研究报告指出目前我国食品安全凸显的4大问题。2009年至2013年国家卫计委网络直报系统共收到食源性疾病暴发事件1244起,累计38958人中毒,749人死亡,病源微生物污染是造成食品中毒死亡的主要原因;农兽药滥用依然是当前食品安全源头污染的主要来源;重金属、真菌毒素等污染物构成粮食食品安全的长远隐患,重金属超标率较高的粮食在南方和西南省区。我国每年有3100万吨粮食在生产、储存、运输过程中被真菌污染,约占粮食年总产量的6.2%;另外,非法添加、掺杂使假和欺诈仍是我国现阶段突出的食品安全问题。
研究报告指出我国食品安全问题原因,首先是农产品产地环境污染严重。我国1/3以上的河段受到污染,90%的地下水遭受不同程度的污染,其中60%严重污染;全国耕地污染总超标率为16.1%,其中中度和重试污染占2.9%。其次是食品工业“小散乱低”占食品企业80%以上,监管难。