1.腐植酸肥效果，因作物种类而异
并非每种作物都对腐植酸表现出肉眼可见的效果。使用时，对作物反应的积极性事先要有认识。
一般认为，在白菜、萝卜、番茄等蔬菜作物上肥效较好，其次是块根、块茎类作物。效果不明显的作物有油菜、蓖麻等油料作物，虽然实际效果是有的，如根系发育的速度、数量及长度等，但数据只能通过科学方法检测，肉眼很难识别。
2.不同时期施用，效果不同
就同种作物而言，宜在作物的生长前期及生殖生长旺盛期施用，此时，叶面喷施腐植酸肥，可被叶片快速吸收。
腐植酸类肥料因养分比例不同，制作方法不同，会导致肥性差异很大。因此，针对不同的作物以及作物所处的生长时期，要用不同的腐植酸肥料，以及合理的用量。农民和经销商一定要按照使用说明施用，不要随意增减用量。
3.掌握施用浓度
因为，腐植酸属于生物刺激素范畴，施用浓度过高可能会导致作物抑制生长，但浓度太低又起不到刺激作物的作用。因此浓度一定要掌握到位。
腐植酸与生长素类似，表现为低浓度促进、高浓度抑制的效应，生长初期的适宜施用浓度为100毫克/升，而生长中、后期施用浓度可在100～500毫克/升范围内变动。
4.配施其他肥料
腐植酸肥含速效养分较化肥低，因此它不能代替化肥，与化肥及农家肥配合施用效果更佳。
5.注意施用温度
腐植酸钾、钠为激素类肥料，应注意温度，施后天冷见效慢，天热见效快，一般温度需在18小时以上。若气温高于38℃时，会加速作物的呼吸作用降低干物质积累，造成减产，应停止施用。
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